Die Klimastation Zell am See befindet sich in 766m Seehöhe im beckenartig erweiterten Gebiet des Zeller Sees am beginn des Oberpinzgaus. Das Klima ist inneralpin mit starker Tagesamplitude der Lufttemperatur, im Winter sonnig, im Sommer oft Quellbewölkung vom Alpenhauptkamm her.